STMIK Widya Pratama telah berhasil menerapkan Sistem Penjaminan Mutu Internal (SPMI) sebagai standar nasional pendidikan tinggi dan ISO 9001 versi 2015 sebagai standar internasional manajemen mutu pendidikan tinggi.
Dengan diterimanya sertifikat ISO 9001 versi 2015 dari BEREAU VERITAS Certivication, menunjukan bahwa STMIK Widya Pratama memiliki komitmen penuh untuk terus meningkatkan kualitas manajemen mutu pendidikan tinggi, agar eksistensi STMIK Widya Pratama dan lulusan STMIK Widya Pratama terus terjaga dan memenangkan persaingan yang semakin ketat